Index of /debian/breseq/breseq-0.36.0/extern/samtools-1.3.1/


../
examples/                                          19-Aug-2021 17:54                   -
htslib-1.3.1/                                      08-Nov-2021 14:41                   -
misc/                                              19-Aug-2021 17:54                   -
win32/                                             19-Aug-2021 17:54                   -
AUTHORS                                            28-May-2014 15:49                 828
ChangeLog.old                                      09-Mar-2012 02:47              116368
INSTALL                                            15-Dec-2015 16:00                5359
LICENSE                                            26-Jun-2014 13:16                1706
Makefile                                           08-Nov-2021 14:41               32106
Makefile.am                                        01-Feb-2020 14:57                2514
Makefile.in                                        08-Nov-2021 14:41               33684
Makefile.mingw                                     07-Jul-2011 03:37                2092
Makefile.original                                  22-Apr-2016 09:51               14541
NEWS                                               22-Apr-2016 08:57               35527
README                                             22-Apr-2016 08:57                2138
aclocal.m4                                         22-Apr-2016 09:51               30114
bam.c                                              15-Jul-2015 13:02                8829
bam.h                                              22-Apr-2016 08:57               20987
bam2bcf.c                                          28-Jan-2016 10:56               31529
bam2bcf.h                                          05-Aug-2015 13:47                5126
bam2bcf_indel.c                                    28-Jan-2016 10:56               24020
bam2depth.c                                        28-Jan-2016 10:56               12735
bam_addrprg.c                                      28-Jan-2016 10:56               14482
bam_aux.c                                          28-Jan-2016 10:56                2769
bam_cat.c                                          14-Apr-2016 13:44               17910
bam_color.c                                        28-Jan-2016 10:56                4951
bam_endian.h                                       01-Aug-2014 14:48                2273
bam_flags.c                                        28-Jan-2016 10:56                3150
bam_import.c                                       22-Oct-2016 00:37                2325
bam_index.c                                        28-Jan-2016 10:56                4062
bam_lpileup.c                                      28-Jan-2016 10:56                6950
bam_lpileup.h                                      01-Aug-2014 14:48                2058
bam_mate.c                                         14-Apr-2016 13:44               14929
bam_md.c                                           23-Mar-2016 15:23               18388
bam_plbuf.c                                        28-Jan-2016 10:56                2110
bam_plbuf.h                                        01-Aug-2014 14:48                1842
bam_plcmd.c                                        05-Feb-2016 17:26               44538
bam_quickcheck.c                                   22-Feb-2016 16:16                5024
bam_reheader.c                                     14-Apr-2016 13:44               16061
bam_rmdup.c                                        06-Apr-2016 09:43               10497
bam_rmdupse.c                                      06-Apr-2016 09:43                7293
bam_sort.c                                         22-Apr-2016 08:07               69208
bam_split.c                                        14-Apr-2016 13:55               20083
bam_stat.c                                         28-Jan-2016 10:56                7400
bam_tview.c                                        28-Jan-2016 10:56               16477
bam_tview.h                                        24-Aug-2015 16:24                3421
bam_tview_curses.c                                 14-Dec-2015 14:44               11520
bam_tview_html.c                                   28-Jan-2016 10:56               10898
bamshuf.c                                          14-Apr-2016 13:44                9010
bamtk.c                                            21-Oct-2016 04:09                9406
bedcov.c                                           28-Jan-2016 10:56                5912
bedidx.c                                           28-Jan-2016 10:56                8696
config.h                                           21-Oct-2016 23:16                  85
config.h.in                                        11-Feb-2016 15:54                1542
config.mk                                          21-Oct-2016 23:16                1694
config.mk.in                                       14-Dec-2015 14:44                1991
configure                                          22-Apr-2016 09:51              154718
configure.ac                                       11-Feb-2016 15:54                3968
cut_target.c                                       28-Jan-2016 10:56                8523
dict.c                                             28-Jan-2016 10:56                5130
errmod.c                                           28-Jan-2016 10:56                6495
errmod.h                                           01-Aug-2014 14:48                1656
faidx.c                                            15-Jul-2015 13:02                2800
install-sh                                         14-Dec-2015 14:44               14675
kprobaln.c                                         28-Jan-2016 10:56               10699
kprobaln.h                                         27-Jun-2014 14:40                1567
padding.c                                          14-Apr-2016 13:44               25794
phase.c                                            14-Apr-2016 13:44               28297
sam.c                                              06-Apr-2016 09:43                4908
sam.h                                              09-Mar-2015 11:28                5317
sam_header.c                                       28-Jan-2016 10:56               22580
sam_header.h                                       01-Aug-2014 14:48                2796
sam_opts.c                                         28-Jan-2016 10:56                5711
sam_opts.h                                         06-Aug-2015 10:32                3879
sam_view.c                                         06-Apr-2016 12:22               37136
sample.c                                           28-Jan-2016 10:56                4540
sample.h                                           01-Aug-2014 14:48                1560
samtools.1                                         22-Apr-2016 08:57               54835
samtools.h                                         19-Aug-2015 15:25                1581
stats.c                                            28-Jan-2016 10:56               70232
stats_isize.c                                      28-Jan-2016 10:56                7608
stats_isize.h                                      01-Aug-2014 14:48                2484
version.h                                          08-Nov-2021 14:41                  33